Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc3Q9QZC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc3Q9QZC1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms