Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plxnb3Q9QY40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plxnb3Q9QY40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plxnb3Q9QY40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms