Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm4Q9QXA5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms