Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1W8

SIRPG, Signal-regulatory protein gamma, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPGQ9P1W8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPGQ9P1W8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIRPGQ9P1W8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPGQ9P1W8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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