Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SACSQ9NZJ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SACSQ9NZJ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms