Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF19Q9NS68 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms