Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO8Q9NRD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO8Q9NRD0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms