Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PnkpQ9JLV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkpQ9JLV6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkpQ9JLV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms