Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Riox1Q9JJF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riox1Q9JJF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms