Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHARPINQ9H0F6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms