Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cldn19Q9ET38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn19Q9ET38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Cldn19Q9ET38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn19Q9ET38 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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