Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap29Q9ERB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snap29Q9ERB0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snap29Q9ERB0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms