Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx12Q9ER00 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx12Q9ER00 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms