Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Xab2Q9DCD2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Xab2Q9DCD2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Xab2Q9DCD2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms