Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrpraQ9DBG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrpraQ9DBG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms