Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Vstm5Q9D806 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm5Q9D806 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms