Protein–RNA interactions for Protein: Q9D709

Tmem79, Transmembrane protein 79, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem79Q9D709 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem79Q9D709 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem79Q9D709 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem79Q9D709 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem79Q9D709 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem79Q9D709 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem79Q9D709 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms