Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp5Q9D387 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lamp5Q9D387 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms