Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prkrip1Q9CWV6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkrip1Q9CWV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms