Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc96Q9CR92 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc96Q9CR92 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms