Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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