Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska1Q9CPV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ska1Q9CPV1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms