Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACSIN1Q9BY11 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN1Q9BY11 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms