Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC106Q9BWC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC106Q9BWC9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC106Q9BWC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms