Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp4Q99ME9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtpbp4Q99ME9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms