Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED2Q99967 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED2Q99967 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms