Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC47Q96A33 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC47Q96A33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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