Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf144aQ925F3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rnf144aQ925F3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnf144aQ925F3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf144aQ925F3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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