Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg8Q8VE18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Smg8Q8VE18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Smg8Q8VE18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Smg8Q8VE18 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Smg8Q8VE18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Smg8Q8VE18 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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Smg8Q8VE18 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg8Q8VE18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms