Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam20bQ8VCS3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20bQ8VCS3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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