Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GcaQ8VC88 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms