Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE23Q8NDY6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms