Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf53Q8N3J3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms