Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1N2

Phldb2, Pleckstrin homology-like domain family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb2Q8K1N2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phldb2Q8K1N2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phldb2Q8K1N2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phldb2Q8K1N2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms