Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh2d5Q8JZW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d5Q8JZW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms