Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS3Q8IXF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms