Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E4f1Q8CCE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E4f1Q8CCE9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms