Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gm9999Q8C5Y2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm9999Q8C5Y2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm9999Q8C5Y2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9999Q8C5Y2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm9999Q8C5Y2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm9999Q8C5Y2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm9999Q8C5Y2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm9999Q8C5Y2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm9999Q8C5Y2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms