Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsper4Q8BVN3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsper4Q8BVN3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms