Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6820408C15RikQ8BJX2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6820408C15RikQ8BJX2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms