Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4dQ8BGV9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4dQ8BGV9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms