Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.6Q85ZW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms