Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms