Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC9Q6ZRR7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC9Q6ZRR7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms