Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms