Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Neil2Q6R2P8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neil2Q6R2P8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.1 ms