Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ttbk1Q6PCN3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ttbk1Q6PCN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ttbk1Q6PCN3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
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