Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr44Q6NVE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms