Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retreg2Q6NS82 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retreg2Q6NS82 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retreg2Q6NS82 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms