Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Knl1Q66JQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Knl1Q66JQ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Knl1Q66JQ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Knl1Q66JQ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms